2019-现在，bob登陆网站 生物医学前沿创新中心（BIOPIC），研究员

2019-现在，北大生命科学学院，研究员

2019-现在，北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG），研究员

2019-现在，生命科学联合中心，研究员

2017-2019，美国加州大学伯克利分校HHMI，博士后

2013-2017，美国霍德华休斯医学研究所（HHMI）Janelia研究园区，研究专员

转录是细胞特异性解读基因组的第一步，也是决定细胞功能和命运的关键步骤。本实验室利用荧光成像，基因组学，生物化学和基因组编辑多种研究手段，研究细胞分化模型和癌症细胞模型中在染色质环境下转录调控的分子机理，以及开发人为控制基因表达的新方法。活细胞中的分子事件是动态发生的而非静止不变的：转录因子在细胞核内与DNA的结合是高度动态和瞬时的，RNA也以爆发式的形式产生。本实验室开发和利用活细胞高速单分子荧光成像技术，研究转录调控因子与染色质的相互作用和在细胞核中的单分子动态，从而阐释转录因子控制细胞状态和命运的机理。染色质在三维空间的构象对远程转录调控至关重要。通过合成特异转录因子可以实现改变染色质三维构象和基因的转录活性。本实验室开发荧光标记基因组DNA的方法，研究染色质空间构象调控的关键蛋白因子，从而探索转录在三维空间的调控机理。

2014-2017, Helen Hay Whitney Foundation Postdoctoral Fellow

2012, President Gutmann Leadership Award

2010, 美国血液学会Merit Award

1. Wang Z#, Wang B#, Niu D#, Yin C, Bi Y, Cattoglio C, Loh KM, Lavis LD, Ge H, Deng W*. Mesoscale chromatin confinement facilitates target search of pioneer transcription factors in live cells. Nature Structural & Molecular Biology. 2024 (Accepted).
2. Han X, Xing L, Hong Y, Zhang X, Hao B, Lu JY, Huang M, Wang Z, Ma S, Zhan G, Li T, Hao X, Tao Y, Li G, Zhou S, Zheng Z, Shao W, Zeng Y, Ma D, Zhang W, Xie Z, Deng H, Yan J, Deng W, Shen X. Nuclear RNA homeostasis promotes systems-level coordination of cell fate and senescence. Cell Stem Cell. 2024 May 2;31(5):694-716.e11.
3. ​Wang H, Li B, Zuo L, Wang B, Yan Y, Tian K, Zhou R, Wang C, Chen X, Jiang Y, Zheng H, Qin F, Zhang B, Yu Y, Liu CP, Xu Y, Gao J, Qi Z, Deng W, Ji X. The transcriptional coactivator RUVBL2 regulates Pol II clustering with diverse transcription factors. Nat Communications 2022;13(1):5703.
4. Z. Wang, and W. Deng#, Dynamic transcription regulation at the single-molecule level. Developmental Biology 482, 67–81(2022).
5. W. Deng#, X. Shi, R. Tjian, T. E. E. Lionnet, and R. H. Singer#, CASFISH: CRISPR/Cas9-mediated in situ labeling of genomic loci in fixed cells. Proceedings of the National Academy of Sciences 112, 11870-11875 (2015).
6. S. C. Knight, L. Xie, W. Deng, B. Guglielmi, L. B. Witkowsky, L. Bosanac, E. T. Zhang, M. E. Beheiry, J.-B. Masson, M. Dahan, and Z. Liu, Dynamics of CRISPR-Cas9 genome interrogation in living cells. Science 350, 823-827 (2015).
7. W. Deng*, J. W. Rupon*, I. Krivega, L. Breda, I. Motta, K. S. Jahn, A. Reik, P. D. Gregory, S. Rivella, A. Dean, and G. A. Blobel, Reactivation of developmentally silenced globin genes by forced chromatin looping, Cell 158, 849-860 (2014).
8. W. Deng, J. Lee, H. Wang, J. Miller, A. Reik, P. D. Gregory, A. Dean, and G. A. Blobel, Controlling long-range genomic interactions at a native locus by targeted tethering of a looping factor. Cell 149, 1233-1244 (2012).
9. T. Tripic*, W. Deng*, Y. Cheng, Y. Zhang, C. R. Vakoc, G. D. Gregory, R. C. Hardison, G. A. Blobel, SCL and associated proteins distinguish active from repressive GATA transcription factor complexes. Blood 113, 2191–2201 (2009).